Какие факторы влияют на степень восстановления файлов:

• Файловая система - восстановление файлов происходит гораздо более успешно с носителей, форматированных в NTFS, нежели чем в форматированные в FAT. Обратите внимание, большинство флеш носителей используют файловую систему FAT.
• Фрагментация - если файл сильно фрагментирован, то его восстановление возможно с NTFS системой, на на носителях в FAT - это очень проблематично.
• Возраст файла - чем меньше был срок жизни файла, тем сложнее будет его восстановить.

Могу ли я восстановить файлы после надежного удаления?

Нет. После такого удаления - восстановление невозможно.

Как работает функция надежного удаления?

Остатки файла после удаления многократно перезаписываются, делая невозможным его восстановление.
Попробуйте сами.

Почему файлы после надежного удаления видны в случае сканирования?

Recuva их видит, но при попытке восстановить - содержимое их не выходит восстановить.